Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CR12Q96Q35 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms