Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC7Q96NW7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms