Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms