Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf85Q96MD7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf85Q96MD7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf85Q96MD7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf85Q96MD7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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