Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms