Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRC1Q96M27 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms