Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SAMD8Q96LT4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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