Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SENP8Q96LD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms