Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX22Q96L94 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX22Q96L94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms