Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL4Q96JB6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL4Q96JB6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms