Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC12Q96J65 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms