Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4CQ96DT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms