Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms