Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTNQ96CV9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTNQ96CV9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms