Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPTQ96BT3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPTQ96BT3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms