Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MAP1LC3B-206ENST00000564844 3085 ntTSL 1 (best)20.33■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 520.18■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT22-206ENST00000535000 1071 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM86B-203ENST00000589190 1508 ntTSL 219.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 BTBD19-205ENST00000475105 505 ntTSL 419.87■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 PHF20L1-202ENST00000315808 2226 ntTSL 1 (best)19.38■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 519.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 SEC22A-208ENST00000487572 870 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTRC-206ENST00000475200 527 ntTSL 319.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-207ENST00000538910 571 ntTSL 519.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-210ENST00000540090 974 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC009292.2-202ENST00000560577 346 ntTSL 519.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-211ENST00000543794 1099 ntTSL 219.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-205ENST00000536971 564 ntTSL 419.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAPOLA-205ENST00000553689 2267 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CABLES1-208ENST00000582882 604 ntTSL 219.24■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSK-205ENST00000563894 1036 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 419.1■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 54.9
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