Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CELF1Q92879 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CELF1Q92879 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CELF1Q92879 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF1Q92879 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms