Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4BQ92750 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms