Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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PTPRUQ92729 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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