Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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