Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms