Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf54Q8WWF1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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