Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC12Q8WUD4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms