Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms