Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CADM4Q8NFZ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms