Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms