Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL3Q8ND23 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL3Q8ND23 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms