Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG8Q8ND04 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms