Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACBD4Q8NC06 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms