Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf106Q8NAJ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf106Q8NAJ2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf106Q8NAJ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf106Q8NAJ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms