Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTBP4Q8N2S1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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LTBP4Q8N2S1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
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