Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC2Q8N158 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms