Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms