Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA4Q8IV77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA4Q8IV77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms