Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms