Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms