Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT27Q7Z3Y8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms