Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OTUD6AQ7L8S5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD6AQ7L8S5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms