Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAD11Q709F0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD11Q709F0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms