Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC23Q6ZST2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms