Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRC9Q6ZRR7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms