Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP6Q6ZN66 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms