Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms