Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms