Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SFTA2Q6UW10 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms