Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUX4L9Q6RFH8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms