Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEPROQ6NW34 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms