Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF123Q5XPI4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms