Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM78BQ5VT40 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM78BQ5VT40 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms