Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms